公路工程和市政公用工程的區別是非常重要的，特別是在資質辦理這個問題上，由于兩者資質不同，需要特別關注。

公路工程資質，是可以承包各級公路建設的建筑資質，包括公路構造的勘察、測量、設計、施工、養護等，專業有路面、路基、隧道、涵洞、安全系統以及公路的綠化等。公路的建設是根據路網規劃的，中國的公路分為國道、省道、縣道和鄉道四個等級，還包括廠礦和林業的專用道路。對于建筑施工企業來說，公路工程施工總承包資質辦理分為特級、一級、二級和三級一共四個等級。

市政公用工程就是城市公共建設的各項工程的總稱，包括城市道路設施、城市橋涵設施、城市排水和防洪設施以及道路照明設施和其他公用設施。市政公用工程主要是服務城市居民生活的，除了道路工程之外，還包括城市園林綠化、房屋建設等。從資質辦理的角度看，市政公用工程的資質等級分為一級、二級和三級三個等級。

因此，公路工程和市政公用工程在本質上是完全不同的兩個工程，但是有人認為市政公用工程中的道路建設和公路工程是重合的，其實不是這樣的。

公路工程包含的公路指的是城市之外的道路，包括縣、鄉道路和城市之間的道路，而市政公用工程的道路指的是市區內的道路，因此兩者在業務上并沒有重疊之處。

在主管部門上，市政公用工程的主管部門是住房建設部門和市政管理部門，而公路工程的管理部門是交通運輸部門。

在具體的施工建設方面，兩者的驗收標準也是不一樣的，市政公用工程是按照市政規范驗收，而公路工程則是按照交通規范驗收。